Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ptchd1Q14B62 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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ptchd1Q14B62 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms