Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rpusd3Q14AI6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpusd3Q14AI6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms