Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Itgb8Q0VBD0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Itgb8Q0VBD0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms