Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Rab42Q0PD08 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms