Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rbp2Q08652 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms