Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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Cnn2Q08093 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Cnn2Q08093 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms