Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cntn3Q07409 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms