Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 1700051K13Rik-201ENSMUST00000204426 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Wfdc12-201ENSMUST00000051272 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 1700010H22Rik-202ENSMUST00000187592 1003 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm18348-201ENSMUST00000191227 820 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smpd1Q04519 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms