Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Gjb4Q02738 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms