Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Cacna1cQ01815 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms