Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Mc1rQ01727 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms