Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Grin2bQ01097 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Grin2bQ01097 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.8 ms