Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SeleQ00690 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SeleQ00690 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms