Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Apoa1Q00623 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Apoa1Q00623 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms