Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ElocP83940 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ElocP83940 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ElocP83940 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms