Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprvP70289 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PtprvP70289 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PtprvP70289 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms