Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rps18P62270 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms