Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ufm1P61961 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ufm1P61961 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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