Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

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Length 70 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Itgad-202ENSMUST00000106237 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sem1P60897 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sem1P60897 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms