Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gsc2P56916 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gsc2P56916 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gsc2P56916 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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