Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Cldn18P56857 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms