Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Sh3bp1P55194 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sh3bp1P55194 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms