Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Rad23bP54728 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rad23bP54728 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Rad23bP54728 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rad23bP54728 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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