Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtpreP49446 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PtpreP49446 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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PtpreP49446 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PtpreP49446 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PtpreP49446 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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PtpreP49446 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
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PtpreP49446 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
PtpreP49446 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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