Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrprbP47758 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
SrprbP47758 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
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