Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab11bP46638 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab11bP46638 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab11bP46638 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab11bP46638 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab11bP46638 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Rab11bP46638 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Rab11bP46638 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Rab11bP46638 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Rab11bP46638 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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