Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Mmp9P41245 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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