Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
VhlP40338 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
VhlP40338 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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