Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ThpoP40226 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
ThpoP40226 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms