Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Col18a1P39061 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms