Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ptk2P34152 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms