Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms