Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hoxd12P23812 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxd12P23812 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms