Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ggta1P23336 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms