Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eif3aP23116 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eif3aP23116 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms