Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Fcer1aP20489 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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