Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P18524 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P18524 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18524 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18524 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18524 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18524 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18524 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
P18524 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.8 ms