Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slco5a1-202ENSMUST00000115403 8509 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Vpreb1P13372 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms