Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DmdP11531 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
DmdP11531 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
DmdP11531 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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DmdP11531 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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DmdP11531 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
DmdP11531 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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