Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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PtprqP0C5E4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Zzef1-201ENSMUST00000069395 11150 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
PtprqP0C5E4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
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