Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
LtaP09225 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms