Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Spta1P08032 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms