Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
P06323 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
P06323 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
P06323 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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