Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
P01660 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
P01660 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms