Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Ccl20O89093 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ccl20O89093 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Ccl20O89093 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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