Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Sdc4O35988 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Sdc4O35988 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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