Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Nek2O35942 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.6 ms