Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Clk2O35491 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Clk2O35491 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Clk2O35491 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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