Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Prrt1O35449 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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