Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Kcns1O35173 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Kcns1O35173 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Kcns1O35173 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms